มังคุด มีสารแซนโทน ( Xanthone ) ซึ่งมีอยู่ในเปลือกมังคุด มากกว่า 40 ชนิด สารแซนโทนนั้นเป็นสารประกอบตามธรรมชาติ มีฤทธิ์เป็นสารต้านอนุมูลอิสระ ช่วยสร้างและปรับสมดุลภูมิคุ้มกันของร่างกาย ช่วยบำรุงร่างกายไม่ให้เกิดอาการภูมิแพ้ เพิ่มความสดชื่น ลดอาการอ่อนเพลีย นอนไม่หลับและความเครียด ช่วยดูแลแผลในกระเพาะอาหาร ตลอดจนลำไส้อักเสบ  ช่วยบำรุงร่างกายให้ไขข้อไม่เสื่อมเร็ว